高新技術(shù)企業(yè)認定的程序如下：
（一）企業(yè)自我評價及申請
企業(yè)登錄“高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”，對照本辦法第十條規(guī)定條件，進行自我評價。認為符合認定條件的，企業(yè)可向認定機構(gòu)提出認定申請。
（二）提交下列申請材料
1.高新技術(shù)企業(yè)認定申請書；
2.企業(yè)營業(yè)執(zhí)照副本、稅務登記證（復印件）；
3.知識產(chǎn)權(quán)證書（獨占許可合同）、生產(chǎn)批文，新產(chǎn)品或新技術(shù)證明（查新）材料、產(chǎn)品質(zhì)量檢驗報告、省級以上科技計劃立項證明，以及其他相關證明材料；
4.企業(yè)職工人數(shù)、學歷結(jié)構(gòu)以及研發(fā)人員占企業(yè)職工的比例說明；
5.經(jīng)具有資質(zhì)的中介機構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個會計年度研究開發(fā)費用情況表（實際年限不足三年的按實際經(jīng)營年限），并附研究開發(fā)活動說明材料；
6.經(jīng)具有資質(zhì)的中介機構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個會計年度的財務報表（含資產(chǎn)負債表、損益表、現(xiàn)金流量表，實際年限不足三年的按實際經(jīng)營年限）以及技術(shù)性收入的情況表。
（三）合規(guī)性審查
認定機構(gòu)應建立高新技術(shù)企業(yè)認定評審專家?guī)欤灰罁?jù)企業(yè)的申請材料，抽取專家?guī)靸?nèi)專家對申報企業(yè)進行審查，提出認定意見。
（四）認定、公示與備案
認定機構(gòu)對企業(yè)進行認定。經(jīng)認定的高新技術(shù)企業(yè)在“高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”上公示15個工作日，沒有異議的，報送領導小組辦公室備案，在“高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”上公告認定結(jié)果，并向企業(yè)頒發(fā)統(tǒng)一印制的“高新技術(shù)企業(yè)證書”。
高新企業(yè)認證條件：
(一)企業(yè)申請認定時須注冊成立一年以上;
(二)企業(yè)通過自主研發(fā)、受讓、受贈、并購等方式，獲得對其主要產(chǎn)品(服務)在技術(shù)上發(fā)揮核心支持作用的知識產(chǎn)權(quán)的所有權(quán);
(三)對企業(yè)主要產(chǎn)品(服務)發(fā)揮核心支持作用的技術(shù)屬于《國家重點支持的高新技術(shù)領域》規(guī)定的范圍;
(四)企業(yè)從事研發(fā)和相關技術(shù)創(chuàng)新活動的科技人員占企業(yè)當年職工總數(shù)的比例不低于10%;
(五)企業(yè)近三個會計年度(實際經(jīng)營期不滿三年的按實際經(jīng)營時間計算，下同)的研究開發(fā)費用總額占同期銷售收入總額的比例符合如下要求：
a. 最近一年銷售收入小于5,000萬元(含)的企業(yè)，比例不低于5%;
b. 最近一年銷售收入在5,000萬元至2億元(含)的企業(yè)，比例不低于4%;
c. 最近一年銷售收入在2億元以上的企業(yè)，比例不低于3%。
其中，企業(yè)在中國境內(nèi)發(fā)生的研究開發(fā)費用總額占全部研究開發(fā)費用總額的比例不低于60%;
(六)近一年高新技術(shù)產(chǎn)品(服務)收入占企業(yè)同期總收入的比例不低于60%;
(七)企業(yè)創(chuàng)新能力評價應達到相應要求;
(八)企業(yè)申請認定前一年內(nèi)未發(fā)生重大安全、重大質(zhì)量事故或嚴重環(huán)境違法行為。
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